17 сентября 2012 г. в 22 часа 20 минут по московскому времени состоялось торжественное закрытие дрейфующей станции «Северный полюс-39»: флаг станции спущен.
С момента открытия станции (1 октября 2011 года) общий дрейф льдины составил 1800 км. Работа полярников на станции продолжалась 353 дня.
После завершения всех операций по снятию имущества дрейфующей станции «Северный полюс-39» со льда, погрузке его на борт ледокола, а также очистке льдины, а/л «Россия» снялся со швартовых и направился в один из перспективных районов для поиска новой льдины, пригодной для размещения станции «Северный полюс-40».
В настоящее время ледовая обстановка в Арктике значительно легче нормы. Площадь ледяного покрова северной полярной области в конце второй декады сентября на 45% меньше нормы и составляет 3,4 млн. кв. км. По данным ААНИИ Росгидромета, осуществляющего ежедневный мониторинг состояния льдов северной полярной области, площадь льда в Арктике наименьшая за 35-летний период наблюдений.